《遊戲人生ZERO》故事圍繞着一統世界的唯一神的寶座，看不到盡頭的大戰延續的時代。 天地割裂，甚至連繁星都被毀滅殆盡的悽慘戰爭， 毫無還手之力的人類在戰爭中一個個死去。 被擁有強大力量的各個種族逼入絕境， 人類瀕臨存亡。
此時率領着人類的年輕領袖名叫「里克」， 他為了讓更多人能迎來明天而嘔心瀝血，日漸憔悴。就在這樣的某天，里克在被棄置的森精種的都城遇到了機凱種少女休比。 對於機械所不該擁有的「心」產生興趣而發生故障， 被同伴拋棄的休比，為了修復故障，而拜託里克把「人類的心」告訴自己。然而，這是在距今超過六千年的遠古時代所編織而成，通往「最新神話」的「最初神話」。未曾留下記錄亦或是記憶，沒有對任何人訴説過的故事，現在開幕。
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